在借鉴发达国家实践经验的基础上，我国孵化器自1987年成立以来，一直以新能源、新材料、节能环保、生物医药、电子信息、高端制造业等新兴产业以及传统产业的升级改造为重点，选择创业“种子”，实施“育苗造林”项目，促进科技成果转化，培育一大批科技型企业和企业家，形成具有中国特色的发展战略、目标定位和运营模式
为实现创新型国家的战略目标，孵化器提供基本保障，如R&D 空、基础设施、技术支持、培训和咨询、管理咨询、融资和市场渠道等。，形成其他中介所不具备的综合服务体系和运行机制，打造成千上万具有前瞻性、带动性、成长型的高新技术企业，用于探索和培育战略性新兴产业的“源头”企业。孵化器已成为国家创新体系建设的重要组成部分，是建设创新型国家的生力军。
企业运营模式是企业孵化器的发展趋势。从欧美的经验来看，孵化器虽然有多种所有制形式，但都是以企业模式运作，产权清晰，特别是欧洲企业孵化器成立时，严格按照市场经济的规范来界定各级组织的产权。我国企业孵化器的运营模式直接或间接依赖政府资金，其创造价值的能力有限，从长远来看是不可持续的。政府只能支持孵化器，不能成为创新和承担风险的主体。孵化器必须像企业一样进行专业化管理，而不是政府的附属机构或部门，通过提供一定的综合设施或服务来促进企业的发展。
预计2019年全国将有2000家孵化器，其中国家级孵化器500家，实行国家级孵化器动态管理和退出机制。30%以上的国家级孵化器建立了创业托儿所和企业加速器，50%以上具有天使投资和持股孵化功能，60%以上的员工在孵化器接受过专业培训，80%建立了公共技术服务平台，90%形成了创业导师辅导体系。
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