腹泻持续2个月以上可称为慢性腹泻，得了慢性腹泻后怎么办呢？首先要分析原因，然后才能对因治疗。
急性腹泻没有彻底治愈而转为慢性这类小儿的营养状况往往比较差，常常因为没有母奶而改吃牛奶。营养差，胃酸和消化酶的分泌量也少，影响了消化功能，使肠道下部的正常细菌离开原来的“岗位’’而转移到肠道的上部，使吃进去的食物分解、发酵、腐败，这些酸性物质可刺激肠道引起腹泻迁延不愈，此时可采用食物疗法。
长期应用抗生素有的小儿由于长期使用抗生素，把肠道内不致病的“正常”细菌统统杀灭或抑制，而“正常”细茵在肠道里可以“监视”、“抑制”肠道内病原菌的生长，缺乏前者的作用以后，致病菌大量繁殖。对这类腹泻首先应停用抗生素，并吃一些扶植“正常”细菌生长的药物。
其他如对某种食物过敏而引起的腹泻，则要停服这类食物；由阿米巴原虫或梨形鞭毛虫引起的腹泻要治疗原发病；少见的如某种消化酶不足则要适当补充有关的酶类；有婴儿湿疹的小儿，吃奶期间大便次数常可增多，但并不影响生长发育，此时尽可“置之不理”并不能断奶；婴儿长期摄入不足，也会造成“饥饿性腹泻”。在明确原因以后，便可对因处理。
