影片《扫毒2》是《扫毒1》的续篇，但故事情节上沒有一切联络，是彻底单独的2个小故事，人物设定也不一样，全是紧紧围绕扫毒进行的。
影片《扫毒1》叙述的是自小一起长大的三兄弟马昊天、张子伟和苏建秋扫毒的事儿，三人都法律效力于冰毒调查组，但苏建秋因不可以和老婆过一切正常日常生活心存退意，马昊天和张子伟劝导苏建秋最终拼一次。
苏建秋跟随毒贩子大哥黑柴去泰国旅游开展买卖，总体目标是看到八面佛，马昊天和张子伟带著别人偷偷追随，可菲律宾警察相互配合不好，曝露了苏建秋的真实身份。
苏建秋同意做了此次买卖，但交易方式中出现意外，马昊天救离开了苏建秋，张子伟被八面佛女儿缅娜救走并结成夫妇，张子伟深爱着缅娜却忘不掉重任，最终协同马昊天和苏建秋等完全祛除了八面佛，缅娜也因而而死。
影片《扫毒2》叙述的是地藏像和西班牙大毒枭黑吃黑引起的中国香港冰毒销售市场事件，警员林正风竭尽全力扫毒，慈善家兼金融业巨头余顺天因儿时爸爸被害的事儿悬赏任务袭击中国香港较大 毒贩子。
但事实上余顺天和地存有不为人知的关联，整整的二十年的师兄弟情义在牌局眼前不值一提，林正风老婆同事连续被害，林正风立誓要祛除中国香港毒贩子。
