首先，要弄清楚两者的定义。在矿物学中，严格的玉的定义只包括了极少几个玉石品种，如翡翠、和田玉等，其中并没有玉髓。但是“玉石”的概念范围就大了很多，玉髓就是玉石之一。其次，玉髓与玉的成分不同，这是两者有区别的重要原因。玉的主要成份均为Ca2(Mg,Fe)5Si8O22(OH)2);而玉髓的化主要成分是二氧化硅(SiO2)，是隐晶质石英的集合体。这样看来，它们并不是同一类物质。玉石中，易与玉髓混淆的玉是是东陵石、密玉、碧玉等。所以在选购时尤其要注意。可以从质地颜色等方面分辨它们。玉髓质地细腻具有隐晶质结构，颗粒微小，肉眼无法看出。而东陵石等最明显的是，颗粒很大，质地相对玉髓而言，比较粗大、粗糙。绿色翡翠、绿松石等，也易与玉髓混淆，也可以通过仔细观察鉴别它们。绿色翡翠有纤维状，玉髓没有；绿松石，透明度低，硬度也低，瓷器光泽。但因为玉的种类很多，无法以共性和玉髓比较，挑选几种和玉髓相似的玉分别来作比较。
绿玉髓与绿色翡翠
绿玉髓表面光亮，质地细腻。颜色通常为苹果绿色，能看见不同程度的深浅变化，呈半透明状。绿玉髓比较脆，加热或暴露于阳光下会使之退色。绿色翡翠具有变斑晶交织结构，可见斑状或纤维状硬玉晶体，外表呈现玻璃光泽，大多半透明或透明，翠色浓艳纯正。在重量上，比重为2.60的绿玉髓比比重为3.24 ~ 3.43的翡翠要轻得多。
绿玉髓与绿松石
绿玉髓一般为半透明，摩氏硬度为6.5～7;绿松石通常不透明，摩氏硬度低，为5～6。两者非常容易分辨。
