煮鸡蛋最好是凉水下锅，水开了再煮3分钟即可。这时的鸡蛋呈溏心状，营养成分最高最利于人体吸收。将鸡蛋洗净后，凉水下锅，开锅后，分别计时3、5分钟，捞出过凉。“3分钟鸡蛋”，蛋清熟而软嫩，蛋黄刚要熟，略溏。“5分钟鸡蛋”，蛋清熟嫩，蛋黄熟而不硬。不同煮沸时间的鸡蛋，在人体内消化时间是有差异的。“3分钟鸡蛋”是微熟，最容易消化，约需1小时30分钟；“5分钟”鸡蛋是半熟，在人体内消化时间约2小时；煮沸时间过长的鸡蛋，在人体内的消化时间相对来说要比较长一点。营养最丰富的是“5分钟鸡蛋”，这种鸡蛋不仅软嫩、蛋香味浓，而且有益人体营养。
如果鸡蛋在沸水中煮超过10分钟，内部会发生一系列的化学变化。蛋白质结构变得更紧密，不容易与胃液中蛋白质消化酶接触，所以较难消化。蛋品中蛋白质含有较多的蛋氨酸，经过长时间加热后，它会分解出硫化物，它与蛋黄中的铁发生反应，形成人体不易吸收的硫化铁，营养损失较多。
煮不熟的鸡蛋危害更大。生鸡蛋不但存在沙门氏菌污染问题，还有抗酶蛋白和抗生物素蛋白两种有害物。前者会影响蛋白质的消化吸收；后者能与食物中的生物素结合，导致人体生物素缺乏，产生精神倦怠、肌肉酸痛等症状。而鸡蛋一经煮熟，上述两种物质才会被破坏。
