甲减的危害不容小觑，如下所示：
1、甲减会影响生长发育
儿童患了甲减，会导致智力落后甚至痴呆，身材矮小等。甲状腺激素对生长激素有促进作用，甲状腺激素缺乏会影响生长激素的促生长作用，儿童甲减往往表现生长迟缓，骨骺愈合慢，骨龄延迟。青少年甲减表现性发育延迟，少数表现性早熟。
2、甲减会影响性能力和生育能力
患了甲减后，女性患者表现月经量多，经期延长，甚至闭经，不易受孕，即使成功怀孕，流产、死胎、胎儿出生后患先天性甲低的几率也非常大；对于男性而言，表现性欲减低、乳房发育、阳痿、不易生育等；而且甲减会遗传，甲减患者后代患甲减的几率也很大。因此，如果患了甲减，医生都会建议治愈后再生孩子。
3、甲减会影响心血管系统
甲状腺激素低下时，体检发现病人心搏缓慢而弱、心音低钝、心脏扩大、心动过缓、下肢浮肿、血压升高、脉压差减低。心肌假性肥大，心电图示低电压，窦性心动过缓。约30%的病人有心包积液，严重者还会出现胸腔或腹腔积液。
4、甲减会影响肌肉关节
甲减病人临床表现乏力，肌肉疼痛、强直、痉挛、水肿和肥大，血清CPK、LDH和AST升高，同功酶主要来自横纹肌。甲减患者的跟腱反射弛张期明显延长，但不够敏感。
5、甲减会影响胃肠系统
食道、胃、胆囊、小肠和结肠的平滑肌张力减弱，胃肠蠕动缓慢，排空时间延长，胃酸分泌减少，血清抗胃壁细胞抗体阳性。病人表现食欲减退、腹胀、恶心、胃酸少、排便困难。
6、甲减会影响血液系统
约25%甲减病人表现贫血，多数为轻度或中度正色素或低色素小细胞贫血，少数为大细胞贫血。 红细胞生成减少原因为：(1)由于代谢减低，氧耗量减少，导致肾脏红细胞生成素减少，(2)甲减对红细胞前体的影响，(3)甲减患者多为女性，月经量增多，(4)胃酸缺乏，胃肠道吸收障碍。 也有部分甲减病人(约12%)表现大细胞贫血，胃壁细胞抗体或内因子抗体阳性，维生素B12或叶酸缺乏，表现大细胞贫血。
