传统药物治疗急性扁桃体炎的方式一般是采用抗菌消炎药治疗，这种局部治疗方式的缺点在于只消，而不能清除扁桃体陷窝内的细菌，一旦身体抵抗力降低极易反复发作，日久则形成慢性病灶。
如果扁桃体炎非常严重而且经常发作，使得孩子的全身性健康都受到影响，或是妨碍到了孩子上学、或呼吸，医生会建议用外科手术将扁桃体切除（扁桃体切除术）。
（孩子必须住院接受这种手术，在手术时还要作全身性麻醉。手术的危险性很小，这种手术可以一劳永逸地解决扁桃体炎的问题。 ）
患儿有以下情况方可考虑体切除：
1、化脓性扁桃体炎反复发作，曾患扁桃体周围脓肿，炎症波及邻近器官，经常发生中耳炎及颈淋巴结炎，扁桃体上常见酪状分泌物，患儿不适；
2、扁桃体重度肥大，妨碍呼吸、吞咽和发音，入睡、睡眠不安；
3、慢性扁桃体炎引起风湿热、等疾病；
4、慢性扁桃体炎引起长期低热、食欲减退、影响孩子的生长发育。
1、患有慢性扁桃体炎的儿童，反复多次发作急性化脓性扁桃体炎，其扁桃体内出现很多小“陷窝”，窝内藏有细菌，经常可以看到小脓点或脓性渗出物。当身体抵抗力下降时，细菌大量繁殖，使扁桃体成为一个“病灶”，必须彻底根除。因为扁桃体炎多数是由乙型溶血性链球菌引起的，这种细菌会引发变态反应，继发风湿性心脏病、肾小球肾炎、性紫癜等。这些疾病会危害一生的健康。这时，应该请有经验的医生确定是否切除扁桃体。
2、扁桃体过度肥大增生，堵塞呼吸道，引起呼吸不畅，入睡后由于肌肉松弛，呼吸更加受阻，表现睡眠不佳，有鼾声、易憋醒、白天无精打采、精神不振。如再有急性炎症发作，阻塞突然加重，可引起严重的呼吸困难，甚至，有可能危及生命。这种情况下，在炎症控制后应考虑切除。多选择进行单侧切除，保留一个相对正常的扁桃体。
治疗注意事项
1、不要轻易作扁桃体切除术。
扁桃体是人体重要的免疫器官，具有细胞免疫和体液免疫的功能，产生的抗体IgA免疫能力强，可抑制细菌在呼吸道粘膜的粘附、生长和扩散，对病毒有中和与抑制扩散作用，其在小儿期（3～5岁）最活跃，切除扁桃体将消除局部的免疫反应，降低呼吸道的抵抗力。
2、扁桃体肿大与扁桃体炎区别。
许多家长一听医生说孩子的扁桃体肿大，就认为得了扁桃体炎。其实扁桃体肿大与扁桃体炎是有着本质的区别的，位于咽部的扁桃体是人体重要的免疫器官，1岁以前扁桃体还未充分发育，扁桃体不肿大，得扁桃体炎的机会也不多，1岁后逐渐增大，4～10岁达到高峰，14～15岁逐渐退化，因此扁桃体炎多见于学龄儿童。学龄儿童单纯的扁桃体肿大（应称之为生理性肥大），无发热和咽痛，检查扁桃体无充血，无脓性分泌物，这是正常现象，不必治疗，同时小儿患扁桃体炎时扁桃体的大小并不表示其炎症轻重的程度。
3、化脓性扁桃体炎是属于细菌感染。
细菌在生长繁殖的过程中会产生一些代谢物，引起机体体温调节中枢改变而发热，在化脓性扁桃体炎的治疗上，使用抗微生物药之后，细菌在短时间内被大量杀死，在机体内崩解，释放出大量毒术，导致了反而在使用抗生术后体温更高，这是一个正常的治疗反应，不必着急，高体温只需对症处理即可。
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