水苏糖进入人体后，不会被人体消化酶水解而完整地进入结肠，被肠道中的双歧杆菌酵解和利用，使其成倍增殖，从而使肠道内有益菌群数量大增。其次，水苏糖被双歧杆菌水解成酸和乳酸，使肠内的pH下降，抑制肠道内有害菌的生长，起到调整肠道微生态平衡的作用。再次，水苏糖被双歧杆菌利用后产生大量的短链脂肪酸，能刺激肠道蠕动、增加粪便湿度并保持一定渗透压，避免了粪便的干结，从而防止便秘的发生。同时水苏糖分子中含有大量的羟基，在肠道中能很好的吸收水分，这样对有治疗作用。因此水苏糖可以从根本上预防结肠癌，防止便秘和腹泻。另外，双歧杆菌在肠道内能自身合成B1、、2、烟酸和等维生素，促进钙、镁等微量元素的吸收。
水苏糖是通过增殖双歧杆菌来达到作用的，水苏糖被双歧杆菌利用后能分解产生多重提高人体免疫力的免疫功能因子—甘露三糖、甘露醇、棉子糖、半乳糖等，甘露三糖及甘露醇正是六味地黄丸的主要成分，可以说水苏糖是免疫因子的母体。
水苏糖能显著增加血液中超氧化物歧化酶(SOD)的活性和含量，减少自由基参与的氧化反应导致的机体衰老，同时水苏糖使得体内功能明显增强，达到减缓皮肤蛋白老化，修护、保湿和滋养皮肤的功效。
水苏糖的功效与作用：排毒
水苏糖通过对肠道某些酶代谢活性的影响，降低肠内有害酶的代谢活性，使得肠道内的甲基酚等腐败产物减少，加速其排出体外，减少有毒代谢物质重吸收，大大减轻了肝脏分解毒素的负担，减少食物残渣在肠道内的停留时间，减少铅在肠道被吸收的可能性。同时，可结合经胆汁分泌进入肠道的铅，被水苏糖排除体外，阻断其再吸收。
水苏糖通过增殖双歧杆菌抑制胆固醇的合成，从而降低血清胆固醇[8];另据人体实验表明，人体舒张压的高低与其粪便中双歧杆菌数量占总细菌数量的比例呈明显的负相关关系.
抗生素在杀死有害菌的同时也杀死了许多对人体健康有益的细菌，长期服用抗生素特别是广谱抗生素，一个明显的副作用就是肠道正常菌群的严重失调，胃肠道功能紊乱，等，服用水苏糖就可以很好地防止使用抗生素副作用的产生。
