据统计，近年来婴幼儿患肛周脓肿的比率逐渐上升。肛周脓肿主要是由于肛管部位感染细菌引起，不当的护理方法、饮食和手术都容易导致宝宝肛周脓肿。肛周脓肿发病原因有以下几种：
1、感染性因素：现代医学认为，感染是引起本病的主要原因。肛周脓肿常见的致病菌有大肠杆菌、金黄色葡萄球菌、链球菌和绿脓杆菌，偶有厌氧性细菌和结核杆菌，常是多种病菌混合感染。肛门周围皮下脓肿引最常见，多由肛腺感染经外括约肌皮下部向外或直接向外扩散而成。
之所以会导致细菌感染，有认为是尿不湿的广泛应用所致。婴幼儿肛门括约肌较松弛，肛管较短，在腹泻和擦大便时易致肛管直肠黏膜外翻，皮肤娇嫩，受尿不湿等擦伤后易发生感染，继发肛周脓肿。
2、医源性因素：临床上属医源性引起的肛门直肠周围脓肿也不少见。这些因素有：内痔插枯痔丁或注射疗法，因操作不当或药剂不洁感染形成粘膜下脓肿；直肠周围注射化学药物刺激，引起组织坏死，造成直肠周围脓肿；乙状结肠镜检查，造成腹膜穿孔感染，引起直肠后间隙脓肿；局部麻醉感染，或油溶液注入后吸收不良，而形成脓肿。
3、手术后因素：临床上亦可见到肛门直肠手术引起感染，而形成的直肠周围脓肿，以及尿道术后感染、等引起的脓肿。
4、外伤因素：外伤、异物或手术后伤口愈合不当都可导致肛周脓肿。绕虫也是诱发肛周脓肿的原因之一。
5、妊娠因素：母亲在怀孕时若子宫内雄性激素过高，会导致胎儿肛门产生异常腺体，这些腺体感染后形成肛周脓肿。
6、其它因素：直肠内异物损伤后感染，放线菌病，直肠憩室炎感染，肛管直肠癌破溃或波及深部的感染，及身体虚弱，抵抗力低下，慢性消耗性疾病，营养不良，腹泻，肠道克罗恩氏病、白血病、AIDS以及其他免疫组织缺陷病等都是肛门直肠周围脓肿的发病原因。
肛周脓肿还容易并发低位肛瘘和坐骨直肠窝脓肿，对患儿身体健康造成巨大伤害。家长需要了解导致小儿肛周脓肿的原因，选择合适的治疗方案，才能有效根治小儿肛周脓肿。
