对喘息严重者，可选用支气管扩张剂，如氨茶碱口服，4-6mg/(kg·次)，每6~8小时1次。
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目的在于使痰液变稀薄，易于排出，以减少细菌感染机会。除加强、拍背、雾化、吸痰外，可选用必嗽平、痰易净等祛痰剂。由于咳嗽是支原体最突出的临床表现，频繁而剧烈的咳嗽将影响患儿的睡眠和休息，可适当给予镇静剂如水合氯醛或苯巴比妥，酌情给予小剂量待因镇咳，但次数不宜过多。
如果患儿出现低热情况的话，则不需要进行处理。而如果体温超过38℃以上的话，则可以服用一些退烧药物进行治疗。
正确选择抗菌素是治疗支原体肺炎成败的关键。支原体肺炎最有效的治疗药物是红霉素类，但由于红霉素可引起较严重的胃肠道反应，可改选其它大环内酯类抗生素如交沙霉素、麦迪霉素、螺旋霉素、白霉素、美欧卡霉素等。新一代大环内酯类抗生素，如罗红霉素、阿奇霉素等由于服药次数少，副作用低，一般需服用2-3周药物，否则容易复发。
