中超第二阶段采用淘汰赛形式，遭到了不少俱乐部反对。据了解，中超正在考虑新方案，在最初，网友就提出了这个方案，希望替代中超第二阶段淘汰赛。中超第二阶段有望是循环赛，第一阶段+第二阶段的成绩，决定冠军、亚冠名额、降级。
此前中超敲定的方案，第二阶段，争冠方案是，第一轮A组1-4名与B组1-4名淘汰赛交叉主客场循环，直到产生冠军；保级组，也同样如此。这种方案一出，就受到了网友质疑，偶然性太大，无论是保级、还是争冠，都不公平。甚至有网友调侃说，18负2平就能够保级。
有网友提出了改进版赛制，就是第二阶段之中，A组前四与B组前四，8支球队进行主客场循环赛制，产生冠军的球队。（第一阶段里，A组前四之间的成绩、B组前四之间交手的成绩，直接带入第二阶段，第二阶段不再交手。）
根据南都记者报道，这个方案成为了职业联盟筹备组谋划的另一个方案，得到了多家俱乐部响应。这份方案提出：第二阶段不应是分组淘汰赛，而应该进行分组循环赛，第一阶段积分部分计入第二阶段，然后算总分，以总分计算最终排名。
