1、物理消毒，物理消毒的水可以加热、过滤、紫外线、辐射消毒等方法。沸腾是最常见的，简单可靠，适合少量水处理。过滤方法简单有效，但只是杀菌而不是杀菌。常用的有砂滤、石棉滤板、纤维酯过滤膜。紫外线在240 ~ 280 nm处杀菌力最强，适合少量水处理。常用的直流和套筒式紫外线消毒器。
2.含氯制剂:含氯饮用水的消毒剂有多种，如漂白粉、次氯酸钙、氯胺、二氯异氰尿酸钠等。由于水源水质不同，加氯量应根据需氯试验确定。对于混凝沉淀过滤后的水或清洁地下水，加氯量为0.5 ~ 1.5毫克/升..水质差1.0 ~ 2.5毫克/升(或1 ~ 4毫克/升)。如果加氯量合适，可以找当地疾控中心求助。
3.二氧化氯:二氧化氯被称为第四代消毒剂，是WHO推荐的处理饮用水最安全的化学药剂，是消毒剂的更新换代产品。在消毒、除臭、除铁等诸多方面优于氯，不产生三氯甲烷致癌物。消毒水时受水温影响较小，对劣质水的杀菌效果优于氯。
4.臭氧消毒:臭氧是一种广谱高效的强氧化剂。其杀菌速度比氯气快600~3000倍。主要用于饮用水消毒、空气体消毒和食品保鲜。臭氧消毒法通常使用干燥空气体或氧气，通过臭氧发生器中的高压电场制备臭氧。消毒时，用臭氧溶解的吸收液与水充分混合。一般臭氧加入量为0.5 ~ 1.5 mg/L，持续5分钟，水中残留臭氧浓度为0.1 ~ 0.5 mg/L，对于重污染水，臭氧量为3 ~ 6 mg/L..近年来，开发了一种用于电解水的臭氧发生器，该发生器结构简单、体积小、重量轻、无噪音、产品中无有害氯化物，可直接用于饮用水消毒。
