科技创新板与新三板的主要区别是:
新三板针对的是已形成规模大、增长率高的企业，科技创新板针对的是创新型科技企业，如:
1.新三板企业成立时间要求两个会计年度；
2.新三板企业股本要求2000万元；
3.新三板企业要求最近连续两年:平均营业收入不低于4000万元，平均净利润不低于2000万元，平均净资产收益率不低于10%，复合增长率不低于50%；
4.新三板要求最近三个月日均市值不低于6亿元；
新三板的缺点:
1.成立时间必须超过两个会计年度。
2.财务门槛高于券商核心，至少需要400万净利润。
3.新三板企业竞争激烈，现在新三板已经分为基础层和创新层，使得基础层的上市企业很难得到投资者的青睐，成为“僵尸”企业。
4.上市审核需要排队，单排队时间就需要半年以上。
5.再次提到券商做市商标准，真正的做市商比例只有10%左右
融资方面，新三板市场严重两极化。目前新三板市场融资金额只有1000亿左右，九鼎、中科商社、同创叶巍、天星资本等PE机构瓜分了300亿科技创新板上市条件。
科技创新局要求R&D最近一年(或第一期)的投资强度不应低于3%，或R&D人员与员工的比例不应低于10%，或高科技产值与营业收入的比例不应低于50%；或者符合上海“四新”经济发展绿皮书中指定的行业；
科技创新板要求“自主创新能力强”，但尚未实现收益或利润；
科技创新板要求企业根据不同情况满足2亿、3亿、6亿的市场价值。市值可以参考上市公司提交申请文件前12个月内股权投资机构对股权投资所做的价格估算，由推荐的业务机构发表专业意见。
目前新三板实行层级制，有基础层和创新层。类似E板和科技创新板；
新三板和科技创新板上市审核需要排队。新增三板约1000个，科技创新板约80个；
新三板有望与上交所、深交所快速对接，科技创新板有望与即将推出的“战略新兴板”快速对接。
