艾草苦燥辛散，能理气血、温经脉、逐寒湿、止冷痛，为妇科要药。用治脘腹冷痛，经寒不调，宫冷不孕等证。炒炭止血，可用治虚寒性月经过多，崩漏下，妊娠胎漏，如胶艾汤。本品捣绒，制成艾条、艾柱，外灸能散寒止痛，温煦气血。煎汤外洗可治湿疮疥癣，祛湿止痒。
艾草预防瘟疫已有几千年的历史，中草药可以就地取材，且现代医学的药理研究表明艾草是一种广谱抗菌抗病毒的药物，它对好多病毒和细菌都有抑制和杀伤作用，对呼吸系统疾病有一定的防治作用。艾草烟薰防疫法是一种简便易行的防疫法。它具有抗菌、抗病毒、平喘、镇咳、祛痰、止血、抗凝血、镇静、抗过敏及护肝利胆等作用。艾草具有一种特殊的香味，这特殊的香味具有驱蚊虫的功效，所以，古人常在门前挂艾草，一来用于避邪，二来用于赶走蚊虫。此外，艾草还可作“艾叶茶”、“艾叶汤”、“艾叶粥”等食谱，以增强人体对疾病的抵抗能力。
艾条是艾草加工成的一种类似香烟但是体积要比香烟大几倍的圆柱状物，点燃艾草条后熏相应的穴位，可以使得艾叶气体向下进入穴位，通过穴位到达经络，再通过经络到达体内，从而起到驱寒和通气血的作用。治疗习惯性流产和不孕不育：将点燃的艾草条放到腹部靠近肚脐处，让烟气顺着肚脐附近的穴位渐渐进入到体内经络，理畅经络和气血，同时这对子宫和卵巢也有非常好的调理作用，长期坚持还可以治疗习惯性流产和不孕不育。
艾条用于灸法，其功效确非我们意想所能及的。艾火的温热刺激能直达深部，经久不消，使人发生畅快之感。若以普通火热，则只觉表层灼痛，而无温煦散寒之作用。灸法也和针法一样，能使衰弱之机能旺盛，也能使亢进之功能得到抑制。虚寒者能补，郁结者能散，有病者能治，无病者灸之可以健身延年。
我国早有使用艾草防疫的传统和古代文献记载，特别是近期从各地的新闻报道中经常可以看到，很多医院使用点燃艾草的方法对医院内的环境进行消毒。
现代有文献研究认为，艾烟消毒作为一种行之有效的空气消毒方法，对多种病原微生物具有杀灭作用，具有与紫外线消毒，过氧乙酸消毒溶液等其他消毒方法相同甚至更为理想的消毒效果。并且传统上认为艾烟对人体皮肤黏膜、呼吸道无刺激作用。
