1痛苦恢复慢
反复的碎石手术给患者带来的痛苦可想而知，同时手术创口较大，恢复速度也是非常慢的，做完手术后患者要忍饥挨饿，不能正常的饮食和活动，给患者日常工作和生活带来了很大的影响。肾结石碎石治疗后要多喝水及多运动，促进结石的排出。
2.损伤肝肾
体外碎石会损伤肾功能和肾脏的生理结构，并会形成肾内疤痕，从而影响人体技能的正常发挥，容易产生各种并发症。同时也阻碍了药物溶石排石的作用的发挥，给结石的彻底治疗也带来了很大的难度。
3.不能根治
体外碎石手术只是针对石头本身的,并不能改善人的体质，而结石并不是人体本身的一个部件头，而是由于后天的种种原因产生的。因此如果不能改善体质而 是一味碎石，就会形成结石长了碎，碎了长，再碎再长、再长再碎的恶性循环，并不能斩断产生结石的根源。因此除非是鹿角样巨大结石，否则是不主张手术治疗 的，即使万不得已做了碎石或手术也一定要及时复查配合对症的药物彻底治疗同时修复器脏的功能。
