作为嬴政的嫡长子，扶苏是不会不娶妻的，但是后世对他妻子的记载是少之又少，几乎可以说是没有任何记载。有些人就根据历史的蛛丝马迹来推测扶苏的妻子，到底出自哪个家族，现在有两种说法，一种说是王翦的后代，一种说法是李斯的女儿。
第一种的说法，来源于历史记录的推断。秦汉时期的历史之中曾经记载过，秦始皇不喜欢的自己的长子扶苏，认为扶苏他太过妇人之仁了，一点都不像自己那样睥睨天下。听到这条消息的扶苏向自己的姻伯王贲救助，希望王贲能够给自己提一些建议。姻伯，是对当时姻亲的称呼，而王贲是王翦的儿子，说明扶苏和王翦是姻亲的关系，所以他的妻子姓王的可能性非常的大。
第二种说法是因为李斯在帮秦始皇取得天下之后，嬴政为了保持和李斯之间的关系，开始实行联姻的政策。嬴政的公子大都娶李斯的女儿或者李斯家族之中的女子为妻，而李斯的儿子也都娶嬴政的女儿为妻。作为嬴政的长子，扶苏娶了李斯嫡系女儿为妻也是有可能的。
但是，第二种说法有着一个很大的漏洞，那就是如果扶苏娶的是李斯的女儿，那么在赵高要杀死扶苏的时候，李斯怎么可能会袖手旁观呢?要知道，自己的女婿继位为帝，自己还会怕一个太监的威胁?其实，当时的太子扶苏和丞相李斯的关系不怎么融洽，两人的政治观点有着很大的分歧，所以扶苏娶李斯之女为妻的可能性是非常小的。
扶苏的儿子大秦帝位最有希望的继承者，公子扶苏，却成为了皇位斗争的牺牲品。那么有很多人会好奇，扶苏到底有没有留下子嗣，或者说扶苏的儿子是谁。
有关扶苏之子的争论到现在一直都没有停过，一种是当时胡亥的继任者子婴就是扶苏的儿子，一种说法是扶苏的子嗣都被赵高屠杀殆尽。
第一种说法是根据历史记载推测而来，《史记》之中的《秦始皇本纪》曾有记载，“立二世之兄子公子婴为秦王”。所以，很多人认为子婴就是扶苏的儿子，汉朝的班固所著的《后汉书》也支持这样的说法。另外，最新修订的《辞海》和《辞源》这两部百科全书，也比较支持第一种说法。原文中的“兄子”现在人们理解为“兄长之子”，胡亥即位之后，将自己的兄长都残杀殆尽，这里的兄长之子很可能是最先死的扶苏之子。
第二种说法是在反驳第一种说法的基础之上得来的，他们的论据来源还是《秦始皇本纪》，据书中记载“子婴与其子密谋杀赵高”。子婴既然能够和自己的儿子商量对策，说明他的儿子至少也应该是15岁以上了，那么子婴应该在30岁左右。扶苏死的时候也才30岁左右，胡亥继位也才过了四五年，如果子婴是扶苏的儿子，那么年龄是不能对上的。
扶苏有后代是肯定的，但是可能已经被赵高和胡亥联手给杀掉了，以赵高和胡亥的行事风格，是不会给自己留下什么后患的。
扶苏之死扶苏，作为始皇帝唯一一个具备统领大局能力的儿子，最终却被小人害死，成为政治斗争的牺牲品。扶苏的死亡，也是导致秦朝二世而亡的一个重要的因素。
秦始皇在病重快死的时候，曾立下一份遗诏，命令扶苏将边境军务交给将军蒙恬，自己即刻返回咸阳，主持葬礼，这等于间接地让扶苏继承自己的帝位了。在秦始皇的眼中，自己的子孙之中，也只有扶苏能够继承帝位，并且能够打理好自己辛辛苦苦打下来的江上。立好遗诏，始皇帝命令赵高派人将这份遗诏送给扶苏，可是当赵高看完遗诏的内容之后，萌生了一个想法，他想立自己的弟子，也就是秦始皇最小的儿子胡亥为帝。
赵高和公子扶苏一直都不太对付，他曾和蒙恬的弟弟有矛盾，两人结下了仇怨，而扶苏和蒙家兄弟二人的关系非常不错，这也就间接地使得扶苏和赵高的关系不太好。另外，扶苏素有大才，如果扶苏当上了皇帝，自己就不能很好地控制他，从而做到把持朝政的目的。反观二子胡亥，出生在秦国富强的时候，从来没有吃过苦，是一个典型的纨绔子弟，再加上赵高这几年来纨绔教育，把胡亥培养成了一个残忍暴戾的皇子，这样的人赵高能够很好地控制他。
赵高想要篡改遗诏，最大的阻碍就是当时的宰相李斯。李斯，身为秦朝开国名相，为大秦建立下了不世之功。但是，李斯有一个最大的缺点，那就是他的家族，由于李斯是白手起家的，所以他非常在意自己家族的存亡。赵高以李斯家族来威胁李斯，无奈李斯只得同意赵高篡改诏书的行为。
最后，赵高将改完的诏书，送给扶苏，看完诏书的扶苏，不顾蒙恬的阻拦，在自己的营帐之中服毒自杀。
